文章摘要
李伟文,许强华,陈新军,戴小杰,朱江峰.基于线粒体控制区的中部太平洋黄鳍金枪鱼种群遗传结构的研究[J].上海海洋大学学报,2014,23(5):782-788
基于线粒体控制区的中部太平洋黄鳍金枪鱼种群遗传结构的研究
Genetic population analysis of Thunnus albacares from central Pacific Ocean based on mitochondrial DNA control region
投稿时间:2013-12-09  修订日期:2014-05-14
DOI:
中文关键词: 黄鳍金枪鱼  中部太平洋  mtDNA控制区  遗传结构
英文关键词: yellowfin tuna (Thunnus albacares)  the central Pacific Ocean  mtDNA control region  genetic population structure
基金项目:国家高技术研究发展计划(2012AA092303);上海市教育委员会科研创新项目曙光计划(13SG51)
作者单位E-mail
李伟文 上海海洋大学 海洋科学学院, 上海 201306  
许强华 上海海洋大学 海洋科学学院, 上海 201306
上海海洋大学 大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室, 上海 201306
农业部大洋渔业资源环境科学观测实验站, 上海 201306
国家远洋渔业工程技术研究中心, 上海 201306 
qhxu@shou.edu.cn 
陈新军 上海海洋大学 海洋科学学院, 上海 201306
上海海洋大学 大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室, 上海 201306
农业部大洋渔业资源环境科学观测实验站, 上海 201306
国家远洋渔业工程技术研究中心, 上海 201306 
 
戴小杰 上海海洋大学 海洋科学学院, 上海 201306
上海海洋大学 大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室, 上海 201306
农业部大洋渔业资源环境科学观测实验站, 上海 201306
国家远洋渔业工程技术研究中心, 上海 201306 
 
朱江峰 上海海洋大学 海洋科学学院, 上海 201306
上海海洋大学 大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室, 上海 201306
农业部大洋渔业资源环境科学观测实验站, 上海 201306
国家远洋渔业工程技术研究中心, 上海 201306 
 
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中文摘要:
      根据2010年9月-2012年1月,我国远洋捕捞船在太平洋中部(16°S~8°N; 160°W~155°E)的7个采样点采集到的101个样本,利用线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)基因的585 bp序列,分析了它们的遗传多样性和遗传结构。结果显示,585 bp片段中发现23个变异位点,80个单倍型;序列多样性分析结果显示,7个采样群体单倍型多样性指数h=0.994±0.002和核苷酸多样性指数π=0.00892±0.00038。分子方差分析揭示98.18%的遗传变异来自种群内,群体间的Fst分析揭示黄鳍金枪鱼7个采样群体内部不存在显著的遗传分化。Fu’s Fs呈负值和核苷酸不配对呈单峰,显示了黄鳍金枪鱼大约在335~544万年前经历了种群扩张;基因交流与遗传分化分析表明,该7个采样点的黄鳍金枪鱼群体之间存在强烈的基因交流,种群遗传分化水平较低。黄鳍金枪鱼种群遗传多样性低,为单一种群,应采用合理的有效措施进行管理,确保黄鳍金枪鱼产业的可持续发展。
英文摘要:
      The samples derived from the Chinese vessels were collected from 7 locations of central Pacific Ocean waters (16°S-8°N;160°W-155°E)from September 2011 to January 2012.By using 585 bp fragments of mtDNA control region, we analyzed the sequence variations and genetic structures of 101 samples collected from 7 locations.In total, 23 variable sites were acquired, and 80 haplotypes were identified.Analysis of mtDNA D-Loop gene sequences from 7 localities revealed that the mean haplotypic diversity and nucleotide diversity was 0.994±0.002 and 0.00892±0.00038, respectively.The AMOVA tests revealed that 98.18% of the genetic variation occurred within populations.Fst analysis suggested that no significant genetic differentiations were found within the 7 localities.Neutrality test and the mismatch distribution indicated a recent population expansion that occurred about 3 350 000-5 440 000 years ago, suggesting a frequency genetic exchange and a poor genetic structure.A single population and a low genetic diversity call for a responsible and effective management to ensure the sustainable development of yellowfin tuna.
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