文章摘要
邓燕飞,赵金良,吴雪峰.斑鳜胃蛋白酶原C及其5'侧翼区的克隆及序列特征分析[J].上海海洋大学学报,2009,(6):.
DENG Yan-fei,ZHAO Jin-liang,WU Xue-feng.Molecular cloning and characterization of pepsinogen C gene and its 5' flanking region from mandarin fish Siniperca scherzeri[J].Journal of Shanghai Ocean University,2009,(6):.
斑鳜胃蛋白酶原C及其5'侧翼区的克隆及序列特征分析
Molecular cloning and characterization of pepsinogen C gene and its 5' flanking region from mandarin fish Siniperca scherzeri
  
DOI:
中文关键词: 斑鳜  胃蛋白酶原C  5'侧翼区  启动子
英文关键词: 
基金项目:江苏省农业科技攻关项目,上海海洋大学博士启动基金,上海教委项目,上海市重点学科建设项目
作者单位
邓燕飞,赵金良,吴雪峰  
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中文摘要:
      采用RT-PCR和RACE等技术克隆了斑鳜(Siniperca scherzeri)胃蛋白酶原C(pepsinogen C,PGC)的cDNA全长和部分DNA序列,结果表明:PGC cDNA序列全长1 505 bp,5'端非翻译区37 bp,3'端非翻译区304 bp,开放阅读框架(ORF)1 164 bp,共编码含有387个氨基酸的蛋白质,包括由16个氨基酸组成的信号肽、39个氨基酸的激活肽和332个氨基酸的成熟肽.斑鳜PGC氨基酸序列与斜带石斑鱼、伯氏豚虾虎鱼、狼鲈、美洲红点鲑4种鱼的相似度分别为92.0%、91.5%、90.2%、89.1%,与非洲爪蟾、鸡、人、兔、褐家鼠的序列相似度分别为76.8%、72.8%、72.5%、69.9%、67.3%,表明PGC基因在长期的进化中较为保守.PGC基因由9个外显子和8个内含子组成,内含子剪切位点符合GT-AG规则,在第7含子中发现(GACA)6、(CA)6类型的微卫星序列,第8内含子中发现(TG)5类型的微卫星序列.采用锚定PCR方法获得了PGC 5'侧翼区长1 924 bp的序列,启动子区域位于-40~+10 bp,包含TATA盒以及GATA-1、CdxA、Hand1/E47、AP-1、Nkx-2、S8、FOX J2等转录因子的结合位点.结果为进一步研究该基因的表达、功能及其转录调控特征奠定了分子基础.
英文摘要:
      
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