刘豪,王成辉,杨新鑫,王军,马玉清.红、白两种体色瓯江彩鲤的抑制性差减杂交[J].上海海洋大学学报,2009,(6):. LIU Hao,WANG Cheng-hui,YANG Xin-xin,WANG Jun,MA Yu-qing.Suppressive subtractive hybridization analysis from red and white color patterns of Oujiang color common carp[J].Journal of Shanghai Ocean University,2009,(6):. |
红、白两种体色瓯江彩鲤的抑制性差减杂交 |
Suppressive subtractive hybridization analysis from red and white color patterns of Oujiang color common carp |
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DOI: |
中文关键词: 瓯江彩鲤 体色 差异表达基因 抑制性差减杂交 |
英文关键词: |
基金项目:国家自然科学基金项目,浙江省自然科学基金项目,上海市重点学科建设项目 |
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中文摘要: |
为了解瓯江彩鲤红、白两种体色差异的分子基础,应用抑制性差减杂交(SSH)技术对这两种体色的差异表达基因进行了初步研究,以"全红"体色(全身体表为红色)彩鲤的cDNA为检验cDNA(Tester),以"粉玉"体色(全身体表为粉白色)彩鲤的cDNA为比对cDNA(Driver),进行抑制差减杂交.对筛选出的42个阳性克隆进行测序和序列比对,发现16条EST序列,其余26个克隆为空载体序列.在16条EST序列中,6条为鲤的线粒体DNA序列(鲤的线粒体:16S rRNA序列,COⅢ),5条为斑马鱼的相关基因序列(斑马鱼的骺蛋白聚糖、核心蛋白聚糖、光蛋白聚糖等相关基因;斑马鱼新型免疫型受体基因,Olfm1蛋白合成基因;斑马鱼原骨胶原蛋白mRNA),1条为鲫的mRNA序列,2条与无脊椎动物基因相类似(利氏曼原虫的22号基因组基因;蝇的抗菌缩氨酸前体mRNA基因),另2条为未知基因序列;比对结果发现4条序列可能与体色有关.为进一步筛选鲤体色调控相关的功能基因奠定了基础. |
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